Técnicamente, no hay ninguna diferencia.
Administrativamente, el dominio ".cl" representa dominios inscritos en Chile y son administrados por NIC Chile. En cambio los dominios ".com", ".net", ".org" son de carácter genérico (no representa ubicación geográfica) y su registro es administrado por varias empresas en forma coordinada a través de todo el mundo.
En un principio se trató de agrupar las empresas comerciales usando el sufijo ".com", los servicios de redes en ".net" y las organizaciones en ".org" Sin embargo en la actualidad esta clasificación no es relevante.
